Proteiinit paljastivat uusia eturauhassyövän mekanismeja
Uudet tautimekanismit paljastuivat proteiiniprofiloinnin avulla. Samalla löydettiin mahdollisia uusia biomarkkereita.
Tampereen yliopiston tutkimuksessa löydettiin proteiiniprofiloinnin avulla sellaisia uusia eturauhassyövän mekanismeja, joita genomitason häiriöt eivät osoita.
Eturauhassyövän kehitykseen vaikuttavia geenejä on tutkittu pitkään. Sen sijaan geenien tuotteiden, proteiinien, muutoksia eturauhassyövässä ei tunneta hyvin.
Tässä tutkimuksessa profiloitiin ensimmäisen kerran massaspektrometrian avulla proteiinien ilmentymistä eturauhassyövässä.
Tutkijat vertasivat proteiini-ilmentymistä samoissa näytteissä olleisiin genomitason ja lähetti-RNA:iden muutoksiin.
Osoittautui, että geenikopiolukumäärän ja DNA-metylaation muutokset selittävät pitkälti lähetti-RNA:n ilmentymistä, mutteivät proteiinitason muutoksia. Yhteys lähetti-RNA:n ja proteiinitasojen välillä oli heikko. Tutkimuksessa löydettiinkin sellaisia tautimekanismeja, joita genomitason häiriöt eivät osoita. Etenkin sitruunahappokierron muutokset nousivat selvästi analyyseissa esille.
Tautimekanismien lisäksi proteiiniprofilointi paljasti useita mahdollisia uusia biomarkkereita. Professori Tapio Visakorven mukaan käyttöä olisi erityisesti sellaisille biomarkkereille, jotka tunnistavat aggressiivisen tautimuodon. Tämä onkin yksi suunta, johon tutkijat nyt keskittyvät.
Tutkimus tehtiin Tampereen yliopiston Eturauhassyöpätutkimuskeskuksen sekä Proteomiikan ja henkilökohtaisen lääketieteen keskuksen yhteistyönä.
Tutkimus julkaistiin Nature Communications -lehdessä.
