Ammatillisen itsenäisyyden saavuttaakseen lääkärin tulisi olla työssään vapaa sidonnaisuuksista, jotka ovat esteenä potilaan kannalta edullisten ratkaisujen tekemiselle. Autonomiaa vähentävät kuitenkin useat tekijät, joista osa johtuu ympäröivästä yhteiskunnasta ja osa lääkärinammatin harjoittajasta. Aikojen kuluessa lääkärin ammattiin on liitetty erilaisia rajoittavia velvoitteita ja ehtoja, joiden vuoksi lääkärin on usein toimittava palkanmaksajan edunvalvojana tai lainsäädäntöä valvovana viranomaisena.