Imeytymisvaiheessa tapahtuvat yhteisvaikutukset voivat muuttaa lääkeaineen imeytymisnopeutta tai kokonaisimeytymistä. Tällä on harvoin kliinistä merkitystä, mutta myös monia kliinisesti tärkeitä, imeytymistä vähentäviä yhteisvaikutuksia tunnetaan. Esimerkiksi antasidit, sukralfaatti, rauta- ja kalsiumvalmisteet sekä nestemäiset maitotuotteet vähentävät huomattavasti monien fluorokinolonien, tetrasykliinien ja bisfosfonaattien imeytymistä. Kolestyramiini ja kolestipoli aiheuttavat myös eräitä tärkeitä yhteisvaikutuksia.