Pakolaisten ja turvapaikanhakijoiden saapumisvaiheen terveystarkastus käsittää viranomaisten nykyisen suosituksen mukaan terveydenhoitajan haastattelun, keuhkojen röntgenkuvauksen, kardiolipiinikokeen sekä vasta-ainemääritykset hepatiitti B -viruksen ja HIV:n varalta. Alkutarkastuksissa on löydetty enimmäkseen infektiotauteja. Löydökset riippuvat ratkaisevasti siitä, mistä maasta pakolaiset ja turvapaikanhakijat ovat lähtöisin. Infektiotaudit eivät kuitenkaan ole merkittävä ongelma, ja vaara, että tartunta leviää ympäristöön, on vähäinen verrattuna suomalaisten ulkomailta tuomiin tartuntoihin.