Depressiolääkkeiden interaktioista kliinisesti tärkein on MAO-A:n estäjä moklobemidin ja serotoniinin takaisinoton estäjien samanaikaisesta käytöstä johtuva serotoniinisyndrooma. Kyseinen oireyhtymä voi esiintyä myös käytettäessä moklobemidia tiettyjen vanhojen masennuslääkkeiden (klomipramiini, tratsodoni) tai eräiden euforisoivien analgeettien (petidiini, dekstropropoksifeeni) kanssa. Eräät serotoninergisten masennuslääkkeiden (esim. fluoksetiini, paroksetiini, fluvoksamiini, sertraliini) tiettyihin sytokromi P450:n isoentsyymeihin (CYP2D6, 3A4, tai 1A2) kohdistuvat estovaikutukset voivat nostaa muiden lääkkeiden pitoisuuksia seerumissa toksiselle tasolle.