Erikoislääkäriyhdistykset ovat huolissaan erikoislääkärikoulutusta vaivaavasta henkilö- ja määrärahapulasta. Erikoistuvan lääkärin työaika kuluu liiaksi rutiinitöissä eikä ohjaavalla lääkärillä ole riittävästi aikaa henkilökohtaiseen ohjaukseen. Lisäksi eri koulutusyksiköiden välillä vallitsee epäyhtenäisyys vaadittavista tiedoista ja taidoista. Tilanteen korjaamiseksi tarvittaisiin taloudellisten panosten lisäksi parempaa yhteistyötä eri yliopistojen välillä sekä aitoa halua parantaa koulutuksen laatua. Konkreettisena parannusehdotuksena on esitetty koulutusvastuun nimeämistä tietylle seniorilääkärille ja rahallisen korvausjärjestelmän kehittämistä. Tiedot käyvät ilmi Nuorten Lääkärien Yhdistyksen tekemästä kyselystä erikoisalayhdistyksille.