HYKS:n sairaanhoitotoimen laatu on korkea. Henkilöstö on vahvasti sitoutunut työhönsä, ja sen ammattitaito on erinomainen. Muun muassa näin arvioi pääjohtaja Jussi Huttunen suorittamassaan HYKS:n sairaanhoitotoiminnan asiantuntijatarkastuksessa. Epäkohtiakin HYKS:n toiminnasta löytyi. Aluesairaalat ja terveyskeskukset kritisoivat hoidollista yhteistyötä riittämättömäksi. HYKS:n sisällä mm. hoidon jatkuvuudessa on puutteita, ja esimerkiksi odotusajat eräisiin poliklinikoihin osoittautuivat liian pitkiksi. Suuren keskussairaaalan sairaanhoidon tarkastuksesta ei Suomessa ollut tätä ennen kokemuksia. Tässä artikkelissa auditointia arvioidaan sekä tarkastetun että tarkastajan näkökulmasta.