Kliinisen mikrobiologian laboratoriotutkimuksia tekee Suomessa noin 400 laboratoriota. Tutkimusten suorittaminen edellyttää toimilupaa, jonka myöntää nykyään lääninhallitus kansanterveyslaitoksen lausunnon perusteella. Toimilupien ensimmäisellä hakukierroksella yli puolet laboratorioista sai Kansanterveyslaitoksen työryhmältä myönteisen lausunnon hakemuksensa ensimmäisessä käsittelyssä, mutta osa laboratorioista oli käsittänyt toimiluvan pelkäksi muodollisuudeksi, ja työryhmä joutui hankkimaan lisätietoja noin 160 laboratoriosta. Osaan niistä tehtiin myös arviointikäynti. Arvioinnissa ilmenneistä heikkouksista merkittävin oli eräissä pienissä laboratorioissa havaittu mikrobiologisen asiantuntemuksen puute. Työryhmä pitää tarkastuskäyntejä erittäin hyödyllisinä: epäkohdat saatiin korjatuksi, ja lopulta vain muutaman laboratorion toimilupahakemusta esitettiin hylättäväksi.