Työterveysyksiköiden käytössä olevat atk-sovellukset vaihtelevat iältään ja toiminnoiltaan. Yleensä tietotekniikkaa käytetään käynti- ja työolotietojen tallennukseen sekä ajanvarauksessa, laskutuksessa ja erilaisissa selonteoissa. Tietojen tallennustapa vaihtelee tiukan määrämuotoisesta vapaamuotoiseen. Sovellusten tärkeimmät kehityskohteet ovat tallennettujen tietojen hyödynnettävyys sekä työolo- ja potilastietojen yhdistäminen. Valtioneuvoston päätös hyvästä työterveyshuoltokäytännöstä seuranta- ja laaduntarkkailuvaatimuksineen edellyttää monelta yksiköltä nykyistä tehokkaampaa ja monipuolisempaa tietojärjestelmää.