Uusi asetus erikoislääkärin tutkinnosta annettiin 4.9.98. Asetuksen siirtymäsäännöstä muutettiin opetusministeriön esittelystä valtioneuvoston istunnossa 30.12.1998 siten, että kahdeksan vuoden koulutukseen ilmoittautumisaikaa pidennettiin eräiltä osin. Sekä asetus erikoislääkärin tutkinnosta (678/1998) että sen 10 pykälä:n siirtymäsäännöstä koskeva muutosasetus (1195/1998) tulivat voimaan 1.1.1999.

Asetuksella 1195/1998 siirtymäsäännöksen 10 pykälä:ään lisätään uusi 3 momentti, jolloin nykyinen momentti siirtyy 4 momentiksi seuraavasti:

Henkilö, joka viimeistään 31 päivänä joulukuuta 1999 on suorittanut loppuun kumotun asetuksen 3 a pykälä:n 1 momentin mukaisen koulutusohjelman, saa suorittaa yhden saman pykälän 2 momentissa tarkoitetun koulutusohjelman sillä edellytyksellä, että hän ei ole aikaisemmin suorittanut yhtään tällaista koulutusohjelmaa ja että hän ilmoittautuu koulutusohjelmaan viimeistään 31. päivänä elokuuta 1999.

Niiden opiskelijoiden osalta, jotka 1 ja 3 momentin mukaisesti opiskelevat kumotun asetuksen mukaisissa koulutusohjelmissa, sovelletaan soveltuvin osin kumotun asetuksen säännöksiä.

Näin ollen ne 31.12.1998 erikoislääkärikoulutuksessa olleet, jotka saavat 6 vuoden koulutusohjelman suoritetuksi viimeistään 31.12.1999, voivat vielä suorittaa yhden 8 vuoden koulutusohjelman vuoden 2005 loppuun asti ulottuvan siirtymäkauden puitteissa. Sama koskee myös niitä jo ennen vuotta 1999 erikoislääkärin tutkinnon suorittaneita, jotka vielä haluavat suorittaa aiempia 8 vuoden koulutusohjelmia edellyttäen, että sellaista ei ole aiemmin suoritettu. Molemmissa tapauksissa ilmoittautuminen lääketieteelliseen tiedekuntaan asianomaiseen koulutusohjelmaan tulee tehdä viimeistään 31.8.1999.

Todettakoon tässä yhteydessä, että erikoislääkärin hallinnon pätevyyttä ei rinnasteta 8 vuoden koulutusohjelmiin. Siten sen voi suorittaa riippumatta 8 vuoden koulutusohjelmien (aikaisempien suppeiden erikoisalojen) suorittamisesta. Hallinnon pätevyyden suorittamisen edellytyksenä on 6 vuoden koulutusohjelman (aiemman pääerikoisalan) suorittaminen. Nykymuotoinen hallinnon pätevyys lakkaa vuoden 2002 lopussa, johon mennessä päätetään sen jatkosta. Hallinnon pätevyyden koulutusohjelmaan ilmoittautumisessa ei ole erikseen säädettyä takarajaa, mutta koulutus tulee olla suoritettuna siis vuoden 2002 loppuun mennessä.

Erikoislääkärikoulutuksen uuden tutkintoasetuksen sisältöä muuten on kuvattu mm. Lääkärilehden numerossa 28/98 (1.10.)