Lääkäriliiton toimintaa on ympäri Suomea. Liiton viimeisen strategiatyön yhteydessä jaettiin liiton toimintaa viiteen alueeseen erva-alueiden mukaan. Toimintaa vetävät piiriylilääkärit. Jokaisella alueella toimii kolme valiokuntaa: edunvalvonta-, professio- ja terveyspolitiikkavaliokunnat. Uudella toimintatavalla on saatu mukaan entistä enemmän kollegoita eri puolilta Suomea. Liitolla on lisäksi ollut jo vuosia paikallis- ja alaosastotoimintaa. Paikallisosastoja on kaikkiaan 35. Jokainen liiton jäsen kuuluu johonkin paikallisosastoon joko työpaikkakuntansa tai asuinkuntansa perusteella. Lisäksi liiton toimintaan kuuluu 26 alaosastoa, jotka ovat muodostuneet lääketieteellisen erikoisalan tai jonkun erikoisteeman ympärille.

Paikallis- ja alaosastotoiminta on liiton säätelemää ja kustantamaa toimintaa. Osa paikallis- ja alaosastoista toimii aktiivisesti ja osan toiminta on lähes sammunut. Niiden toiminta vaatii aktiivisia liiton jäseniä vetämään ja toimimaan johtokunnissa. On tärkeää, että Lääkäriliitolla on jäsenilleen tarjolla erilaisia vaikutuskanavia. Jäsenen täytyy saada tietoa liiton toiminnasta ja hänellä täytyy olla mahdollisuus osallistua toimintaan. Lääkäriliiton juuri uudistetuilta nettisivustoilta jokainen jäsen voi löytää tietoa paikallis- ja alaosastoista.

Paikallis- ja alaosastotoiminnan kuten valiokuntatoiminnankin on tarkoitus parantaa jäsenten vaikutusmahdollisuuksia. Paikallis- ja alaosastoissa kollegoiden on mahdollisuus verkostoitua ja keskustella työhön liittyvistä asioista. Liiton kannalta tärkeitä asioita ovat lääkärien työhyvinvointi, edunvalvonnalliset asiat, terveyspolitiikka, kollegiaalisuus ja professioon liittyvät teemat. Ammatillinen täydennyskoulutus ei kuulu näissä liiton kustantamaksi toiminnaksi vaan kuuluu muille tahoille.

Paikallis- ja alaosastojen toimintaa johtavat johtokunnat, jotka valitaan osastojen vuosikokouksissa. Johtokunnan tehtävänä on keskustella ja edistää edellä mainittuja asioita lääkärien hyväksi ja järjestää myös koko jäsenistölleen tilaisuuksia. Liiton henkilökunta on käytettävissä asiantuntijoina kokouksissa. Ulkopuolisiakin luennoitsijoita on mahdollista pyytää mukaan. Johtokunta tekee toimintasuunnitelman ja talousarvion vuosittain. Osaston vuosikokous hyväksyy ne. Talousarvion laatimiseen on Lääkäriliiton hallitus juuri hyväksynyt uudet ala- ja paikallisosastojen talousohjeet.

Paikallis - ja alaosastotoiminnan kehittämiseksi Lääkäriliitossa toimii tällä hetkellä työryhmä. Toiminta yritetään saada paremmin tunnetuksi ja entistä innostavammaksi ja lääkärien kannalta hyödyllisemmäksi. Uusimpina alaosastoina ovat juuri aloittaneet tietojärjestelmään perehtyneiden ja siitä kiinnostuneiden lääkärien ja yksityislääkärien alaosastot. Paikallis- ja alaosastoissa toivotaan vilkasta keskustelua ja viestittämistä Lääkäriliittoon. Toiminnan kautta voidaan tehdä aloitteita liiton hallitukselle saakka. Osastot pitävät sääntöjen mukaan pöytäkirjaa ja pöytäkirjat toimitetaan Lääkäriliittoon. Sitä kautta paikallis- ja alaosastoissa esillä olleet asiat tulevat jäsenpalvelutoimialan johtajalle tietoon. Paikallis- ja alaosastot ilmoittavat kokouksistaan Lääkärilehdessä. Seuratkaa hyvät kollegat ilmoituksia ja tulkaa mukaan toimintaan keskustelemaan ja vaikuttamaan.