Myös pienimolekyylinen hepariini aiheuttaa trombopeniaa
Fraktioimaton hepariini aiheuttaa trombopeniaa vajaalle prosentille käyttäjistä. Fraktioidun eli pienimolekyylisen hepariinin kohdalla ei ole tiedetty, mikä on trombopenian ilmaantuvuus. Italialaisessa monikeskustutkimuksessa seurattiin prospektiivisesti yli 1 750:n pienimolekyylistä hepariinia saaneen potilaan trombosyyttilukua. Jos lukema laski yli 50 % hoidon aikana, pidettiin tätä hepariinin aiheuttamana trombopeniana, ellei muuta ilmeistä syytä tarjoutunut. Edellytettiin, että potilailla oli hepariiniin liittyviä IgG-luokan vasta-aineita.